Jan-29 （Wed） 「細胞・免疫・遺伝子」

特別講演　 16:10－17:00​

座長：岩見真吾 / 九州大学大学院 理学研究院生物科学部門​

「細胞制御メカニズム理解のための数理モデル構築とツール開発」

講演者
 岡田 眞里子 / 大阪大学 蛋白質研究所


​生物学研究における数理モデルの利点は、計測し得るすべてのデータをパラメータとして入力することで細胞を統合的・定量的に理解できる点にある。発表者らは、細胞の運命決定機構を分子レベルで理解するため、シグナル伝達、転写、細胞周期の実験計測と統合数理モデルの構築を進めている。本発表では、これらを進めるにあたり、同時に構築している数理モデル基盤およびツールも含めて説明する。

招聘講演　 15:30－16:00​

座長：岩見真吾 / 九州大学大学院 理学研究院生物科学部門​

「数理モデリングを用いたMRSAによる持続性菌血症の決定因子の同定」

講演者
​　三日市 剛 /第一三共株式会社 研究開発本部


​MRSAによって引き起こされる持続性菌血症（persistent bacteremia、PB）は、重篤度が高く、抗菌剤による治療が難しい感染症である。一方、患者より単離された菌株は in vitro でバンコマイシンに対する感受性を維持する。数日以内に寛解する菌血症（resolving bacteremia）とPBを決定付ける因子は不明であり、それらを同定することは臨床的意義が高い。本研究では、臨床診断、治療選択、再発などを含めた数理モデルを作成し、PBを決定する因子の同定に成功した。

シンポジウム　 10:00－12:00

「データから読み解く免疫のダイナミクス​」

企画者
 川上 英良
/理化学研究所 医科学イノベーションハブ推進プログラム,
​千葉大学大学院 医学研究院


​近年、次世代シーケンサーなどの計測技術の発展と人工知能技術の普及により、急速に医学研究にデータ駆動型研究の導入が進んでいる。本シンポジウムでは、機械学習を始めとした、データに基づいて複雑な疾患や生命現象の潜在的な特徴やダイナミクスを明らかにする研究に焦点を当て、生命科学・医学分野におけるデータ駆動型研究の潮流と展望を議論する場としたい。

講演者

「多細胞動態のデータ駆動モデル」
　本田 直樹 / 京都大学 生命科学研究科 生命動態研究センター
「高次元小標本データのための非線形統計モデリング」
　山田誠
 　/ 京都大学情報学研究科、理化学研究所革新知能統合研究センター
「非負値テンソル分解を用いた細胞間相互作用の推定」
　露崎弘毅 / 理化学研究所 生命機能科学研究センター
「時系列データに基づく生命・疾患の状態記述と遷移モデル」
　川上英良
 　/ 理化学研究所 医科学イノベーションハブ推進プログラム、千葉大学大学院 医学研究院

一般講演　 13:30－15:30

 座長：川上 英良 / 理化学研究所 医科学イノベーションハブ推進プログラム、千葉大学大学院 医学研究院
​​コメンテーター：望月 敦史 / 京都大学 ウィルス・再生医科学研究所 生命システム研究部門
①13:30 - 13:50
　昌子 浩登 / 関西学院大学 理工学部
　「異方的拡散により形成されるチューリングパターン」

②13:50 - 14:10
　太田 圭祐 / 北海道大学 理学部 生物科学科
　「炎症性腸疾患を対象にした腸内細菌叢および菌叢代謝の層別解析」

③14:10 - 14:30
　吉戸 香奈 / 京都大学 生命科学研究科
　「適応免疫におけるヘルパーT細胞および制御性T細胞の記憶ダイナミクス」

④14:30 - 14:50
　岩波 翔也 / 九州大学大学院 システム生命科学府
　「１造血幹細胞移植実験のデータ解析と造血幹細胞の老化」

〇14:50 - 15:00   ＜休憩＞

⑤15:00 - 15:15
　田口 優真 / 名古屋大学 情報文化学部 自然情報学科
　「腸内細菌叢の数理モデルとその相互作用行列の解析」

⑥15:15 - 15:30
　大河内 康之 / 京都大学 生命科学研究科
　「scRNAseqからの空間的遺伝子発現パターンの再構成手法」

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懇親会　 19:00～

詳細は Conferece Dinner のページ からご確認ください。